Во второй половине 2002 года ФЭК России рассмотрел заявление Дальневосточной железной дороги о разногласиях, связанных с государственным регулированием тарифов на электрическую и тепловую энергию в Приморском крае. Принято решение в пользу ДВЖД. Благодаря обращению Дальневосточной железной дороги в арбитражный суд с иском, магистрали в течение 2003 года будет возвращено 110 миллионов рублей, необоснованно выплаченных энергосистеме. Всего за 2002 год железными дорогами было подано 18 исков о признании недействительными решений региональных энергетических комиссий субъектов Российской Федерации об установлении тарифов на электрическую энергию, потребляемую электрифицированным железнодорожным транспортом. 9 исков удовлетворено, по 4 искам заключено мировое соглашение. В 2003 году в связи с установлением Региональной энергетической комиссии Хабаровского края тарифов с нарушением постановления Правительства РФ «О ценообразовании в отношении электрической и тепловой энергии», МПС обратилось в ФЭК России.