Строительство первой ГЭС на вечной мерзлоте началось в 1960 г. и связано с формированием горнодобывающего комплекса отечественной алмазной промышленности. Основным потребителем электроэнергии до сих пор остается ЗАО «АЛРОСА».

ГЭС была построена в 2 очереди. 4 агрегата первой очереди были запущены в эксплуатацию к декабрю 1968 года. Последний 4-ый агрегат второй очереди ГЭС был запущен в 1978 году. Работу станции обеспечивает Вилюйское водохранилище площадью 2360 кв. км. И емкостью больше 40 куб. километров.

При создании водохранилища было затоплено 2,3 тыс.га сельхозугодий и перенесено 50 строений.